В 2008 году Институт провел 34 экспедиции общей продолжительностью 514 суток. В рейсах приняло участие 379 научных сотрудников и представителей 36 организаций шести министерств и ведомств России и иностранные участники из организаций Аргентины, Голландии, Великобритании.
Успешная научная экспедиционная деятельность судов основана на сочетании коммерческой и научной деятельности. Наличие фрахтов создает финансовую основу проекта. Фрахтователи оплачивают ремонты, содержание, снабжение судов, зарплату и питание экипажей практически на протяжении всего года. Кроме того, они оплачивают переходы судна к месту проведения научных работ и обратно.
Помимо проекта «Меридиан-плюс» ФЦП «Мировой океан» Институт продолжал наращивать активную экспедиционную деятельность на хоздоговорной основе.
